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Le Boc-pGlu-OEt (ester éthylique de l'acide N-Boc-L-pyroglutamique, également connu sous le nom de Boc-Pyr-OEt ou éthyl (S)-1-Boc-5-oxopyrrolidine-2-carboxylate) est un dérivé protégé de l'acide L-pyroglutamique. La molécule comporte un noyau d'acide pyroglutamique – un acide aminé cyclique formé par cyclisation intramoléculaire de l'acide glutamique – avec un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) protégeant l'azote du cycle et un ester éthylique protégeant l'acide carboxylique.

Le Z-Trp(Boc)-OH.DCHA (sel de dicyclohexylammonium Nα-Z-Nᶦⁿ-Boc-L-tryptophane) est un dérivé du L-tryptophane doublement protégé comportant deux groupes protecteurs orthogonaux. La molécule est constituée d'un noyau L-tryptophane avec un groupe carbobenzoxy (Z) protégeant la fonctionnalité α-amino et un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) protégeant l'azote de la chaîne latérale indole.

Boc-D-Phe-OH (N-α-tert-Butoxycarbonyl-D-phénylalanine) est un dérivé protégé de D-phénylalanine comportant un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) attaché à la fonctionnalité α-amino. La molécule se compose d’un noyau de phénylalanine de configuration D – un acide aminé chiral avec une chaîne latérale benzyle – avec le groupe protecteur Boc protégeant le groupe amino des réactions secondaires indésirables.

GS-650804 / Boc-(S)-cyclopropylglycine (acide N-[(1,1-diméthyléthoxy)carbonyl]-(S)-amino-cyclopropylacétique) est un acide aminé non naturel protégé par Boc comportant un groupe cyclopropyle au niveau du carbone α de l'échafaudage de la glycine. Ce motif structurel unique combine le cycle cyclopropyle à contrainte stérique avec la chiralité de la configuration (S), créant un analogue d'acide aminé conformationnellement verrouillé qui est très apprécié en chimie médicinale et en recherche sur les peptides.

Boc-His(Trt)-Ala-OH (N-[(1,1-diméthyléthoxy)carbonyl]-1-(triphénylméthyl)-L-histidyl-L-alanine) est un élément constitutif dipeptide protégé comportant un résidu histidine protégé par Boc à l'extrémité N-terminale avec un groupe trityle (Trt) sur la chaîne latérale imidazole, couplé à un résidu alanine à l'extrémité C.

Pal-Lys(Boc)-OH (N-[(1,1-diméthyléthoxy)carbonyl]-L-lysine palmitoyl ester) est un dérivé d'acide aminé spécialisé comportant un squelette de lysine avec deux modifications : un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyl (Boc) sur la fonctionnalité α-amino et un groupe ester palmitoyl (hexadécanoyl) sur le carboxyle de la chaîne latérale.