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Le produit Fmoc-N-Méthyl-L-Val-OH (IUPAC : N-[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-N-méthyl-L-valine, également connu sous le nom de Fmoc-N-Me-Val-OH) est un dérivé protégé spécialisé N-α-Fmoc de la N-méthyl-L-valine. La molécule est construite sur la chaîne latérale aliphatique ramifiée de la valine, mais la modification structurelle déterminante est la substitution de l'hydrogène du squelette amide par un groupe méthyle au niveau de l'atome d'azote.

Fmoc-AzaTrp-OH (Fmoc-L-7-azatryptophane, également connu sous le nom de (S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)méthoxy)carbonyl)amino)-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)acide propanoïque) est un élément constitutif d'acides aminés spécialisé protégé par Fmoc qui incorpore un système de cycle aza-indole à la place du chaîne latérale indole standard du tryptophane. Le groupe protecteur Fmoc à l'extrémité N-terminale permet une intégration transparente dans les flux de travail Fmoc SPPS standard, tandis que le fragment 7-azatryptophane introduit un atome d'azote dans le cycle indole qui modifie considérablement les propriétés électroniques et de liaison hydrogène de la chaîne latérale.

Le Boc-Pip (Fmoc) -OH (acide 4-(Boc-amino)-1-Fmoc-pipéridine-4-carboxylique, CAS 368866-07-3) est un dérivé d'acide aminé non naturel à conformation contrainte, construit sur un système de cycle pipéridine. La molécule comporte un noyau d'acide pipéridine-4-carboxylique avec deux groupes protecteurs orthogonaux : un groupe tert-butoxycarbonyle (Boc) protégeant l'azote 4-amino et un groupe 9-fluorénylméthoxycarbonyle (Fmoc) protégeant l'azote du cycle en position 1.

Fmoc-Sar-OH.H2O est la forme protégée par Fmoc de la sarcosine (N-méthylglycine), fournie sous forme cristalline monohydratée. La sarcosine est l'acide aminé N-alkylé le plus simple, comportant un groupe amino secondaire (-NH-) à la place du groupe amino primaire présent dans les acides α-aminés standards. Cette différence structurelle modifie fondamentalement le comportement conformationnel des peptides contenant de la sarcosine : le groupe N-méthyle restreint la flexibilité du squelette, réduit la propension aux liaisons hydrogène et confère des préférences de structure secondaire uniques non accessibles avec les résidus d'acides aminés conventionnels.

Fmoc-N-Me-Trp(Boc)-OH (N-α-(9-Fluorenylmethoxycarbonyl)-N-α-methyl-N-in-tert-butoxycarbonyl-L-tryptophane, CAS 197632-75-0) est un dérivé de tryptophane N-méthylé di-protégé conçu pour la synthèse peptidique en phase solide (SPPS) à base de Fmoc. La molécule intègre trois caractéristiques structurelles clés : un groupe Fmoc protégeant la fonction α-amino, un groupe N-méthyle au niveau de l'azote α et un groupe Boc protégeant l'azote indole de la chaîne latérale du tryptophane.

Fmoc-Asp(OMpe)-OH (ester β-3-méthylpent-3-yle de l'acide N-α-Fmoc-L-aspartique) est un dérivé de l'acide L-aspartique protégé par Fmoc et portant le groupe protecteur de chaîne latérale β-3-méthylpent-3-yl (OMpe) stériquement exigeant. Le composé a été spécifiquement développé comme une alternative avancée au standard Fmoc‑Asp(OtBu)‑OH pour une utilisation dans la synthèse peptidique en phase solide (SPPS) Fmoc, où un traitement répétitif à la pipéridine pendant la déprotection Fmoc peut autrement déclencher une formation importante de sous-produits liés à l'aspartimide au niveau des résidus aspartyles, en particulier dans les séquences Asp‑Gly, Asp‑Ser et Asp‑Thr.