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Boc-L-Homophe-OH (N-Boc-L-homophénylalanine) est un acide aminé non naturel protégé par Boc, comportant un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) protégeant la fonctionnalité α-amino et une chaîne latérale homophénylalanine - un groupe phénylpropyle s'étendant à partir du carbone α. La formule moléculaire est C₁₅H₂₁NO₄ avec un poids moléculaire de 279,33 g/mol. La présence du groupe Boc rend le groupe amino inerte dans une large gamme de conditions de réaction, permettant des manipulations sélectives à l'extrémité acide carboxylique ou ailleurs dans la molécule.

Boc-Asn-OH (Nα-(tert-Butoxycarbonyl)-L-asparagine, CAS 7536-55-2) est un dérivé protégé par Boc de l'acide aminé naturel L-asparagine. La molécule comporte un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyl (Boc) attaché au groupe α-amino, préservant la fonctionnalité amine pendant la synthèse peptidique tout en laissant le groupe carboxyle et le carboxamide à chaîne latérale disponibles pour des transformations sélectives.

Boc-D-Leu-OH·H₂O (N-Boc-D-leucine monohydraté, CAS 16937-99-8) est la forme cristalline monohydratée et protégée par N-Boc de l'énantiomère D non naturel de l'acide aminé essentiel leucine. La molécule comporte un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyl (Boc) attaché au groupe α-amino de la D-leucine, protégeant l'amine pendant la synthèse peptidique tout en préservant l'acide carboxylique libre pour les réactions de couplage.

L'acétate de Boc-méthioninethiol (CAS 139429-04-2) est un dérivé d'acide aminé spécialisé protégé par Boc présentant une fonctionnalité thioacétate. La molécule incorpore un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyle (Boc) sur le fragment amino, combiné à une charpente thiol dérivée de la méthionine qui a été acétylée pour former le dérivé thioacétate (S-acétyle).

Boc-Ala-OH (N-(tert-Butoxycarbonyl)-L-alanine) est un dérivé d'acide aminé protégé par Boc comportant un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyl (Boc) attaché au groupe α-amino de la L-alanine. La molécule se compose d’un carbone chiral central portant un groupe amino (protégé comme carbamate), d’un acide carboxylique et d’une chaîne latérale méthyle – l’échafaudage d’acides aminés chiraux le plus simple.

Le Boc-pGlu-OEt (ester éthylique de l'acide N-Boc-L-pyroglutamique, également connu sous le nom de Boc-Pyr-OEt ou éthyl (S)-1-Boc-5-oxopyrrolidine-2-carboxylate) est un dérivé protégé de l'acide L-pyroglutamique. La molécule comporte un noyau d'acide pyroglutamique – un acide aminé cyclique formé par cyclisation intramoléculaire de l'acide glutamique – avec un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) protégeant l'azote du cycle et un ester éthylique protégeant l'acide carboxylique.