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Boc-D-Phe-OH (N-α-tert-Butoxycarbonyl-D-phénylalanine) est un dérivé protégé de D-phénylalanine comportant un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) attaché à la fonctionnalité α-amino. La molécule se compose d’un noyau de phénylalanine de configuration D – un acide aminé chiral avec une chaîne latérale benzyle – avec le groupe protecteur Boc protégeant le groupe amino des réactions secondaires indésirables.

GS-650804 / Boc-(S)-cyclopropylglycine (acide N-[(1,1-diméthyléthoxy)carbonyl]-(S)-amino-cyclopropylacétique) est un acide aminé non naturel protégé par Boc comportant un groupe cyclopropyle au niveau du carbone α de l'échafaudage de la glycine. Ce motif structurel unique combine le cycle cyclopropyle à contrainte stérique avec la chiralité de la configuration (S), créant un analogue d'acide aminé conformationnellement verrouillé qui est très apprécié en chimie médicinale et en recherche sur les peptides.

Boc-His(Trt)-Ala-OH (N-[(1,1-diméthyléthoxy)carbonyl]-1-(triphénylméthyl)-L-histidyl-L-alanine) est un élément constitutif dipeptide protégé comportant un résidu histidine protégé par Boc à l'extrémité N-terminale avec un groupe trityle (Trt) sur la chaîne latérale imidazole, couplé à un résidu alanine à l'extrémité C.

Pal-Lys(Boc)-OH (N-[(1,1-diméthyléthoxy)carbonyl]-L-lysine palmitoyl ester) est un dérivé d'acide aminé spécialisé comportant un squelette de lysine avec deux modifications : un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyl (Boc) sur la fonctionnalité α-amino et un groupe ester palmitoyl (hexadécanoyl) sur le carboxyle de la chaîne latérale.

H-D-Lys(Boc)-NH2 (N⁶-(tert-Butoxycarbonyl)-D-lysine amide) est un dérivé de D-lysine à énantiomère unique, protégé orthogonalement. Avec la formule moléculaire C₁₁H₂₃N₃O₃ et un poids moléculaire de 245,32 g/mol, ce composé présente une architecture moléculaire constituée d'un groupe α-amino libre, d'un carboxamide C-terminal et d'une chaîne latérale ε-amino protégée par un tert-butoxycarbonyl (Boc).

Le Boc-Pip-OtBu (tert-butyl 4-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}pipéridine-4-carboxylate) est un dérivé de pipéridine protégé comportant deux groupes protecteurs tert-butyle. Avec la formule moléculaire C₁₅H₂₈N₂O₄ et un poids moléculaire de 300,39 g/mol, ce composé présente un cycle pipéridine avec les fonctionnalités amine et carboxyle protégées respectivement sous forme de carbamates de tert-butyle et d'esters de tert-butyle.