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H-D-Lys(Boc)-NH2 (N⁶-(tert-Butoxycarbonyl)-D-lysine amide) est un dérivé de D-lysine à énantiomère unique, protégé orthogonalement. Avec la formule moléculaire C₁₁H₂₃N₃O₃ et un poids moléculaire de 245,32 g/mol, ce composé présente une architecture moléculaire constituée d'un groupe α-amino libre, d'un carboxamide C-terminal et d'une chaîne latérale ε-amino protégée par un tert-butoxycarbonyl (Boc).

Le Boc-Pip-OtBu (tert-butyl 4-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}pipéridine-4-carboxylate) est un dérivé de pipéridine protégé comportant deux groupes protecteurs tert-butyle. Avec la formule moléculaire C₁₅H₂₈N₂O₄ et un poids moléculaire de 300,39 g/mol, ce composé présente un cycle pipéridine avec les fonctionnalités amine et carboxyle protégées respectivement sous forme de carbamates de tert-butyle et d'esters de tert-butyle.

Le Boc-Alaninol (N-Boc-(S)-2-aminopropanol) est un aminoalcool chiral dérivé de la L-alanine, comportant un groupe protecteur tert-butyloxycarbonyle (Boc) sur l'amine et un groupe hydroxyle primaire libre. La molécule, de formule moléculaire C₈H₁₇NO₃ et de poids moléculaire de 175,23 g/mol, présente une configuration (S) bien définie au stéréocentre adjacent à l'amine, l'établissant comme un élément constitutif chiral énantiopur.

Boc-Pro-NH₂ (N-(tert-butoxycarbonyl)-L-prolinamide, CAS 35150-07-3) est un dérivé protégé par Boc de la L-proline comportant un amide primaire en position C2. La molécule est constituée d'un cycle pyrrolidine avec un groupe tert-butyloxycarbonyle (Boc) protégeant l'azote du cycle et d'un groupe carboxamide (-CONH₂) au stéréocentre C2.

Fmoc-Lys(C16-OtBu)-OH (CAS 2952671-06-4) est un dérivé de lysine spécialisé protégé par Fmoc comportant un fragment lipidique C16 à longue chaîne (groupe hexadécanoyl/palmitoyle) attaché au groupe ε-amino de la lysine via une liaison amide, l'acide carboxylique C-terminal étant protégé comme un ester tert-butylique. Cette architecture moléculaire unique combine la fonctionnalité α-amino protégée par Fmoc requise pour la synthèse peptidique en phase solide avec une chaîne alkyle lipophile en C16 qui confère des propriétés amphiphiles aux peptides résultants.

Fmoc-D-Trp-OH (Nα-Fmoc-D-tryptophane, CAS 86123-11-7) est un dérivé protégé par Fmoc de l'énantiomère D du tryptophane, un acide aminé aromatique essentiel. La molécule contient le groupe 9-fluorénylméthoxycarbonyle (Fmoc) protégeant la fonction α-amino, tandis que l'acide carboxylique reste libre pour l'allongement de la chaîne peptidique. La chaîne latérale indole du Fmoc-D-Trp-OH offre à la fois un caractère aromatique et une capacité de liaison hydrogène, faisant de ce composé un élément de base précieux pour l'incorporation de résidus D-tryptophane dans des séquences peptidiques via la synthèse peptidique en phase solide (SPPS) de Fmoc.